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新药发现解决方案
概览
在制药行业的新药研发场景下，研究人员和制药公司面临着处理海量生物数据、执行复杂模拟的挑战，传统计算资源难以满足需求。为解决这一痛点，亚马逊云科技构建了新药研发高性能计算解决方案指南。该指南将强大的云端高性能计算资源与先进的药物发现算法相结合，使研究人员能够高效处理大型数据集、执行复杂模拟并分析生物数据，大幅提升新药研发效率。同时，该解决方案覆盖从基因组测序到分子建模的各种应用场景，并确保遵守行业法规和数据安全标准。该指南基于 Amazon Batch、Amazon ECR、Amazon S3 等云服务构建。
方案优势
按需部署，方便快捷
一键式按需部署的计算集群。方便快捷的配置方法及流程，适配多种计算机型。
基于最佳实践的软件封装
自动安装 Schrodinger 软件包，支持亚马逊云科技公开数据集引用分析，支持
Amazon SageMaker 二次分析计算结果。
自定义工具流，灵活掌控
支持 Shell 基本流程，支持 KNIME Workflow 面向新药研发三件套。
解决方案架构及说明
以下架构图展示了整个方案的部署架构。(可单击图片放大查看)
图1：基于 Amazon Batch 构建容器化 Gromacs 计算环境
- 上传输入文件到 Amazon S3。
- 触发计算事件。
- 根据不同的计算任务需求，投递到不同计算实例类型计算。
- 调取软件 docker 镜像，例如 Gromacs。
- 计算过程中中间结果文件与 Amazon S3 交互。
- 利用 Amazon S3 文件生命周期归档智能管理不同类型文件。
