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新药发现解决方案

概览

在制药行业的新药研发场景下,研究人员和制药公司面临着处理海量生物数据、执行复杂模拟的挑战,传统计算资源难以满足需求。为解决这一痛点,亚马逊云科技构建了新药研发高性能计算解决方案指南。该指南将强大的云端高性能计算资源与先进的药物发现算法相结合,使研究人员能够高效处理大型数据集、执行复杂模拟并分析生物数据,大幅提升新药研发效率。同时,该解决方案覆盖从基因组测序到分子建模的各种应用场景,并确保遵守行业法规和数据安全标准。该指南基于 Amazon BatchAmazon ECRAmazon S3 等云服务构建。

方案优势

按需部署,方便快捷

一键式按需部署的计算集群。方便快捷的配置方法及流程,适配多种计算机型。

基于最佳实践的软件封装

自动安装 Schrodinger 软件包,支持亚马逊云科技公开数据集引用分析,支持 Amazon SageMaker 二次分析计算结果。

自定义工具流,灵活掌控

支持 Shell 基本流程,支持 KNIME Workflow 面向新药研发三件套。

解决方案架构及说明

以下架构图展示了整个方案的部署架构。(可单击图片放大查看)

图1:基于 Amazon Batch 构建容器化 Gromacs 计算环境
  1. 上传输入文件到 Amazon S3
  2. 触发计算事件。
  3. 根据不同的计算任务需求,投递到不同计算实例类型计算。
  4. 调取软件 docker 镜像,例如 Gromacs。
  5. 计算过程中中间结果文件与 Amazon S3 交互。
  6. 利用 Amazon S3 文件生命周期归档智能管理不同类型文件。
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由西云数据运营的
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