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多组学数据分析最佳实践
此亚马逊云科技解决方案有何用途 ？
该解决方案帮助用户准备基因组、临床、突变、表达和成像数据以进行大规模分析，并针对数据湖执行交互式查询，包括作为代码自动化的基础架构、用于转换数据的摄取管道，以及用于交互式分析的笔记本和仪表板。
方案优势
轻松准备和加载数据
通过
Amazon Glue 对来自癌症基因组图谱 (TCGA) 计划、癌症影像档案 (TCIA)、1000 Genomes 项目和 ClinVar 的多组数据集进行准备，方便大规模分析与查询。
可视化界面
通过
Amazon QuickSight 中的可视界面分析多模式数据；数据缓存在 SPICE（超快速、并行、内存计算引擎）数据库中，优化查询性能。
加速构建与协作
通过
Amazon SageMaker 笔记本环境提供的一键式 Jupyter 笔记本分析数据，几秒钟内立即开始工作；后台自动弹性调节资源，不会造成中断；自动捕获代码依赖项，方便协作与同步。
解决方案架构及说明
以下架构图展示了整个方案的部署架构。
- 通过 Amazon CLI 部署 Hail 模型到 Amazon EMR
- 利用 Amazon SageMaker Notebook 提交测试代码
- 利用 Amazon S3 整合不同组学数据
- Hail 模型与 Amazon SageMaker 联合分析
