概览
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在制药行业的新药研发场景下,研究人员和制药公司面临着处理海量生物数据、执行复杂模拟的挑战,传统以命令行方式执行的高性能计算 (HPC) 环境对药物研发机构使用门槛高,管理运维复杂,为解决这一痛点,该指南提供了简单易用的图形化界面帮助用户快速构建药物研发 HPC 集群以及部署蛋白质结构预测、虚拟筛选、分子动力学模拟等药物研发常用计算应用,大幅降低系统的运维和使用成本,提升新药要发效率。该指南基于 Amazon API Gateway、Amazon Lambda、Amazon ECR 等服务构建。
在制药行业的新药研发场景下,研究人员和制药公司面临着处理海量生物数据、执行复杂模拟的挑战,传统以命令行方式执行的高性能计算 (HPC) 环境对药物研发机构使用门槛高,管理运维复杂,为解决这一痛点,该指南提供了简单易用的图形化界面帮助用户快速构建药物研发 HPC 集群以及部署蛋白质结构预测、虚拟筛选、分子动力学模拟等药物研发常用计算应用,大幅降低系统的运维和使用成本,提升新药要发效率。该指南基于 Amazon API Gateway、Amazon Lambda、Amazon ECR 等服务构建。
客户应用场景
客户应用场景
通过直观 Web UI,研究人员无需命令行,即可轻松创建和管理用于分子动力学模拟、蛋白质结构预测等分子建模任务的 HPC 集群 —— 一站式管理多个分子建模集群,提高研发效率。
根据药物研发工具的动态负载需求,可在UI上快速扩缩集群的 CPU/GPU 等资源 —— 按需灵活分配计算资源,加速药物研发数据分析,节省成本。
优化集群架构和调度策略,充分释放计算资源以加速虚拟筛选过程 —— 实时监控作业队列和资源利用情况,确保关键分子优化任务高效运行。
基于不同新药项目,创建逻辑隔离的HPC资源池 —— 个性化定制每个项目的模拟参数和算法,加速创新。
优势
优势
简单易用的图形界面
研发科学家可通过简单易用的图形界面轻松管理和使用药物研发 HPC 集群环境,无需云计算与 HPC 专家的帮助。
快速部署常用药物研发软件
IT 管理人员可以通过预置镜像的方式在集群内快速部署常用的药物研发软件,及时响应业务需求。
提升集群管理运维效率
通过界面上集成的系统监控信息,快速定位排查系统问题,并可以监控费用消耗情况。
架构图及说明
用户登录系统,通过图形化界面配置集群,提交创建请求。
Amazon API Gateway 调用 Amazon ParallelCluster API 创建集群
用户通过 SSM 登录集群头节点,提交作业。
集群根据作业需求创建计算节点,完成计算任务。
通过 NICE DCV 以远程桌面的方式登录头节点,对计算结果进行可视化分析
架构图及说明
用户登录系统,通过图形化界面配置集群,提交创建请求。
系统将集群创建请求发送至集群管理的 Amazon API Gateway
Amazon API Gateway 调用 Amazon ParallelCluster API 创建集群
用户通过 SSM 登录集群头节点,提交作业。
集群根据作业需求创建计算节点,完成计算任务。
通过 NICE DCV 以远程桌面的方式登录头节点,对计算结果进行可视化分析